Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
HDAC11Q96DB2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC11Q96DB2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms