Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GCC1Q96CN9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GCC1Q96CN9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GCC1Q96CN9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GCC1Q96CN9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GCC1Q96CN9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GCC1Q96CN9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GCC1Q96CN9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GCC1Q96CN9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GCC1Q96CN9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GCC1Q96CN9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GCC1Q96CN9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
GCC1Q96CN9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GCC1Q96CN9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GCC1Q96CN9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GCC1Q96CN9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GCC1Q96CN9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GCC1Q96CN9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GCC1Q96CN9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GCC1Q96CN9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GCC1Q96CN9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GCC1Q96CN9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GCC1Q96CN9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GCC1Q96CN9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GCC1Q96CN9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GCC1Q96CN9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GCC1Q96CN9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GCC1Q96CN9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GCC1Q96CN9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GCC1Q96CN9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GCC1Q96CN9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GCC1Q96CN9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GCC1Q96CN9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GCC1Q96CN9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GCC1Q96CN9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GCC1Q96CN9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GCC1Q96CN9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GCC1Q96CN9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GCC1Q96CN9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
GCC1Q96CN9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
GCC1Q96CN9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GCC1Q96CN9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
GCC1Q96CN9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GCC1Q96CN9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GCC1Q96CN9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GCC1Q96CN9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GCC1Q96CN9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GCC1Q96CN9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GCC1Q96CN9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GCC1Q96CN9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GCC1Q96CN9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GCC1Q96CN9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GCC1Q96CN9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
GCC1Q96CN9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GCC1Q96CN9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GCC1Q96CN9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GCC1Q96CN9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GCC1Q96CN9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GCC1Q96CN9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GCC1Q96CN9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
GCC1Q96CN9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GCC1Q96CN9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GCC1Q96CN9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GCC1Q96CN9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
GCC1Q96CN9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
GCC1Q96CN9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GCC1Q96CN9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GCC1Q96CN9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms