Protein–RNA interactions for Protein: Q96AQ1

CCDC74A, Coiled-coil domain-containing protein 74A, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74AQ96AQ1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC74AQ96AQ1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC74AQ96AQ1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC74AQ96AQ1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC74AQ96AQ1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC74AQ96AQ1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC74AQ96AQ1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC74AQ96AQ1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC74AQ96AQ1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC74AQ96AQ1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC74AQ96AQ1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC74AQ96AQ1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC74AQ96AQ1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC74AQ96AQ1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC74AQ96AQ1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC74AQ96AQ1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC74AQ96AQ1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC74AQ96AQ1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC74AQ96AQ1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC74AQ96AQ1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC74AQ96AQ1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC74AQ96AQ1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC74AQ96AQ1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC74AQ96AQ1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC74AQ96AQ1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC74AQ96AQ1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC74AQ96AQ1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC74AQ96AQ1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC74AQ96AQ1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC74AQ96AQ1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC74AQ96AQ1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC74AQ96AQ1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC74AQ96AQ1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC74AQ96AQ1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC74AQ96AQ1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC74AQ96AQ1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC74AQ96AQ1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC74AQ96AQ1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC74AQ96AQ1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC74AQ96AQ1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC74AQ96AQ1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC74AQ96AQ1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC74AQ96AQ1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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CCDC74AQ96AQ1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC74AQ96AQ1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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CCDC74AQ96AQ1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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CCDC74AQ96AQ1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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CCDC74AQ96AQ1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC74AQ96AQ1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC74AQ96AQ1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC74AQ96AQ1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC74AQ96AQ1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC74AQ96AQ1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC74AQ96AQ1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC74AQ96AQ1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC74AQ96AQ1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC74AQ96AQ1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC74AQ96AQ1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
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CCDC74AQ96AQ1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC74AQ96AQ1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC74AQ96AQ1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC74AQ96AQ1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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