Protein–RNA interactions for Protein: Q96AE7

TTC17, Tetratricopeptide repeat protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC17Q96AE7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TTC17Q96AE7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms