Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCE1Q969G3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCE1Q969G3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCE1Q969G3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCE1Q969G3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCE1Q969G3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCE1Q969G3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCE1Q969G3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCE1Q969G3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCE1Q969G3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCE1Q969G3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCE1Q969G3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCE1Q969G3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCE1Q969G3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCE1Q969G3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCE1Q969G3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCE1Q969G3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCE1Q969G3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCE1Q969G3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCE1Q969G3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCE1Q969G3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCE1Q969G3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.3 ms