Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCAMP4Q969E2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.3 ms