Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-CQ95604 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-CQ95604 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-CQ95604 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-CQ95604 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-CQ95604 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-CQ95604 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-CQ95604 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-CQ95604 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-CQ95604 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-CQ95604 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-CQ95604 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-CQ95604 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-CQ95604 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-CQ95604 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-CQ95604 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-CQ95604 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-CQ95604 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-CQ95604 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-CQ95604 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-CQ95604 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-CQ95604 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-CQ95604 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-CQ95604 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-CQ95604 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-CQ95604 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-CQ95604 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-CQ95604 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-CQ95604 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-CQ95604 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-CQ95604 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-CQ95604 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-CQ95604 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-CQ95604 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-CQ95604 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-CQ95604 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-CQ95604 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-CQ95604 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-CQ95604 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-CQ95604 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-CQ95604 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-CQ95604 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-CQ95604 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-CQ95604 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-CQ95604 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-CQ95604 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-CQ95604 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-CQ95604 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-CQ95604 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-CQ95604 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-CQ95604 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-CQ95604 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-CQ95604 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-CQ95604 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HLA-CQ95604 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms