Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF4BQ92750 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms