Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
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