Protein–RNA interactions for Protein: Q8WU68

U2AF1L4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L4Q8WU68 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms