Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF40

FNIP1, Folliculin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNIP1Q8TF40 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNIP1Q8TF40 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNIP1Q8TF40 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNIP1Q8TF40 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNIP1Q8TF40 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNIP1Q8TF40 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNIP1Q8TF40 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNIP1Q8TF40 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNIP1Q8TF40 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNIP1Q8TF40 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNIP1Q8TF40 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNIP1Q8TF40 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNIP1Q8TF40 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNIP1Q8TF40 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNIP1Q8TF40 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNIP1Q8TF40 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNIP1Q8TF40 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNIP1Q8TF40 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNIP1Q8TF40 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNIP1Q8TF40 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNIP1Q8TF40 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FNIP1Q8TF40 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNIP1Q8TF40 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNIP1Q8TF40 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNIP1Q8TF40 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNIP1Q8TF40 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNIP1Q8TF40 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms