Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBZ0

CCDC110, Coiled-coil domain-containing protein 110, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC110Q8TBZ0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC110Q8TBZ0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms