Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms