Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PIK3C3Q8NEB9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms