Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC197Q8NCU1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC197Q8NCU1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms