Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ5

COLGALT1, Procollagen galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT1Q8NBJ5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COLGALT1Q8NBJ5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms