Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF2

NHLRC2, NHL repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC2Q8NBF2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NHLRC2Q8NBF2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NHLRC2Q8NBF2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NHLRC2Q8NBF2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NHLRC2Q8NBF2 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NHLRC2Q8NBF2 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NHLRC2Q8NBF2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NHLRC2Q8NBF2 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NHLRC2Q8NBF2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NHLRC2Q8NBF2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NHLRC2Q8NBF2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NHLRC2Q8NBF2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NHLRC2Q8NBF2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NHLRC2Q8NBF2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NHLRC2Q8NBF2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NHLRC2Q8NBF2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NHLRC2Q8NBF2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NHLRC2Q8NBF2 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NHLRC2Q8NBF2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms