Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN19Q8N6F1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN19Q8N6F1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN19Q8N6F1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN19Q8N6F1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN19Q8N6F1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN19Q8N6F1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN19Q8N6F1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN19Q8N6F1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN19Q8N6F1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN19Q8N6F1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN19Q8N6F1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN19Q8N6F1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN19Q8N6F1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
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CLDN19Q8N6F1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN19Q8N6F1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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CLDN19Q8N6F1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
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CLDN19Q8N6F1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN19Q8N6F1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN19Q8N6F1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN19Q8N6F1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN19Q8N6F1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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CLDN19Q8N6F1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
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CLDN19Q8N6F1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
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CLDN19Q8N6F1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN19Q8N6F1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
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CLDN19Q8N6F1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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CLDN19Q8N6F1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN19Q8N6F1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN19Q8N6F1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN19Q8N6F1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
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CLDN19Q8N6F1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN19Q8N6F1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN19Q8N6F1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN19Q8N6F1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
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CLDN19Q8N6F1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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CLDN19Q8N6F1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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CLDN19Q8N6F1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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CLDN19Q8N6F1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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CLDN19Q8N6F1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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