Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Y2

MSL3, Male-specific lethal 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3Q8N5Y2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MSL3Q8N5Y2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MSL3Q8N5Y2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MSL3Q8N5Y2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MSL3Q8N5Y2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MSL3Q8N5Y2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MSL3Q8N5Y2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MSL3Q8N5Y2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MSL3Q8N5Y2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MSL3Q8N5Y2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MSL3Q8N5Y2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MSL3Q8N5Y2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MSL3Q8N5Y2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MSL3Q8N5Y2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms