Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC33Q8N5R6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC33Q8N5R6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms