Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
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