Protein–RNA interactions for Protein: Q8N145

LGI3, Leucine-rich repeat LGI family member 3, humanhuman

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Length 548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGI3Q8N145 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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LGI3Q8N145 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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LGI3Q8N145 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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LGI3Q8N145 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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LGI3Q8N145 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LGI3Q8N145 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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LGI3Q8N145 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LGI3Q8N145 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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LGI3Q8N145 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LGI3Q8N145 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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LGI3Q8N145 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LGI3Q8N145 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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LGI3Q8N145 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LGI3Q8N145 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LGI3Q8N145 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LGI3Q8N145 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LGI3Q8N145 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LGI3Q8N145 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LGI3Q8N145 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LGI3Q8N145 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
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LGI3Q8N145 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LGI3Q8N145 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LGI3Q8N145 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LGI3Q8N145 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LGI3Q8N145 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LGI3Q8N145 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LGI3Q8N145 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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