Protein–RNA interactions for Protein: Q86YC2

PALB2, Partner and localizer of BRCA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALB2Q86YC2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PALB2Q86YC2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PALB2Q86YC2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PALB2Q86YC2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PALB2Q86YC2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PALB2Q86YC2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PALB2Q86YC2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PALB2Q86YC2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PALB2Q86YC2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PALB2Q86YC2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PALB2Q86YC2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PALB2Q86YC2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PALB2Q86YC2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PALB2Q86YC2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PALB2Q86YC2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PALB2Q86YC2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PALB2Q86YC2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PALB2Q86YC2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PALB2Q86YC2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PALB2Q86YC2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PALB2Q86YC2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PALB2Q86YC2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PALB2Q86YC2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PALB2Q86YC2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PALB2Q86YC2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PALB2Q86YC2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PALB2Q86YC2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PALB2Q86YC2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PALB2Q86YC2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PALB2Q86YC2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PALB2Q86YC2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PALB2Q86YC2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PALB2Q86YC2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PALB2Q86YC2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PALB2Q86YC2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PALB2Q86YC2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PALB2Q86YC2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PALB2Q86YC2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PALB2Q86YC2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PALB2Q86YC2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PALB2Q86YC2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PALB2Q86YC2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PALB2Q86YC2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PALB2Q86YC2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PALB2Q86YC2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PALB2Q86YC2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PALB2Q86YC2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PALB2Q86YC2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PALB2Q86YC2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PALB2Q86YC2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PALB2Q86YC2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PALB2Q86YC2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PALB2Q86YC2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PALB2Q86YC2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PALB2Q86YC2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PALB2Q86YC2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PALB2Q86YC2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PALB2Q86YC2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PALB2Q86YC2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PALB2Q86YC2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PALB2Q86YC2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PALB2Q86YC2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PALB2Q86YC2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PALB2Q86YC2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PALB2Q86YC2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PALB2Q86YC2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PALB2Q86YC2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PALB2Q86YC2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PALB2Q86YC2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PALB2Q86YC2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PALB2Q86YC2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PALB2Q86YC2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PALB2Q86YC2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PALB2Q86YC2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PALB2Q86YC2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PALB2Q86YC2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PALB2Q86YC2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PALB2Q86YC2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PALB2Q86YC2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PALB2Q86YC2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PALB2Q86YC2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PALB2Q86YC2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PALB2Q86YC2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PALB2Q86YC2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PALB2Q86YC2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PALB2Q86YC2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PALB2Q86YC2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PALB2Q86YC2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PALB2Q86YC2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PALB2Q86YC2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PALB2Q86YC2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PALB2Q86YC2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PALB2Q86YC2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PALB2Q86YC2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PALB2Q86YC2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PALB2Q86YC2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PALB2Q86YC2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PALB2Q86YC2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PALB2Q86YC2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PALB2Q86YC2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 186.2 ms