Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SKAP1Q86WV1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SKAP1Q86WV1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SKAP1Q86WV1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SKAP1Q86WV1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SKAP1Q86WV1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SKAP1Q86WV1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SKAP1Q86WV1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SKAP1Q86WV1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SKAP1Q86WV1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SKAP1Q86WV1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SKAP1Q86WV1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SKAP1Q86WV1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SKAP1Q86WV1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SKAP1Q86WV1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SKAP1Q86WV1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SKAP1Q86WV1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SKAP1Q86WV1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SKAP1Q86WV1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SKAP1Q86WV1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SKAP1Q86WV1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SKAP1Q86WV1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SKAP1Q86WV1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SKAP1Q86WV1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SKAP1Q86WV1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SKAP1Q86WV1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SKAP1Q86WV1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SKAP1Q86WV1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SKAP1Q86WV1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SKAP1Q86WV1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SKAP1Q86WV1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SKAP1Q86WV1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SKAP1Q86WV1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SKAP1Q86WV1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SKAP1Q86WV1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SKAP1Q86WV1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SKAP1Q86WV1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SKAP1Q86WV1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SKAP1Q86WV1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SKAP1Q86WV1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SKAP1Q86WV1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SKAP1Q86WV1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SKAP1Q86WV1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SKAP1Q86WV1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SKAP1Q86WV1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SKAP1Q86WV1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SKAP1Q86WV1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SKAP1Q86WV1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SKAP1Q86WV1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SKAP1Q86WV1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SKAP1Q86WV1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SKAP1Q86WV1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SKAP1Q86WV1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SKAP1Q86WV1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SKAP1Q86WV1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SKAP1Q86WV1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SKAP1Q86WV1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SKAP1Q86WV1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SKAP1Q86WV1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SKAP1Q86WV1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SKAP1Q86WV1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SKAP1Q86WV1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SKAP1Q86WV1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SKAP1Q86WV1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SKAP1Q86WV1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SKAP1Q86WV1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SKAP1Q86WV1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SKAP1Q86WV1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SKAP1Q86WV1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SKAP1Q86WV1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SKAP1Q86WV1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SKAP1Q86WV1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SKAP1Q86WV1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SKAP1Q86WV1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SKAP1Q86WV1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SKAP1Q86WV1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SKAP1Q86WV1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SKAP1Q86WV1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SKAP1Q86WV1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SKAP1Q86WV1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SKAP1Q86WV1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SKAP1Q86WV1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SKAP1Q86WV1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SKAP1Q86WV1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SKAP1Q86WV1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SKAP1Q86WV1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SKAP1Q86WV1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SKAP1Q86WV1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SKAP1Q86WV1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SKAP1Q86WV1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SKAP1Q86WV1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SKAP1Q86WV1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SKAP1Q86WV1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SKAP1Q86WV1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SKAP1Q86WV1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SKAP1Q86WV1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SKAP1Q86WV1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SKAP1Q86WV1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SKAP1Q86WV1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SKAP1Q86WV1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms