Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW6

N4BP2, NEDD4-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP2Q86UW6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
N4BP2Q86UW6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
N4BP2Q86UW6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
N4BP2Q86UW6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
N4BP2Q86UW6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
N4BP2Q86UW6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
N4BP2Q86UW6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
N4BP2Q86UW6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
N4BP2Q86UW6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
N4BP2Q86UW6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
N4BP2Q86UW6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
N4BP2Q86UW6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
N4BP2Q86UW6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
N4BP2Q86UW6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
N4BP2Q86UW6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
N4BP2Q86UW6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
N4BP2Q86UW6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
N4BP2Q86UW6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
N4BP2Q86UW6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
N4BP2Q86UW6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
N4BP2Q86UW6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
N4BP2Q86UW6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
N4BP2Q86UW6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
N4BP2Q86UW6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
N4BP2Q86UW6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
N4BP2Q86UW6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
N4BP2Q86UW6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
N4BP2Q86UW6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
N4BP2Q86UW6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
N4BP2Q86UW6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms