Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6E9

RBBP6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP6Q7Z6E9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBBP6Q7Z6E9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RBBP6Q7Z6E9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBBP6Q7Z6E9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RBBP6Q7Z6E9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBBP6Q7Z6E9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBBP6Q7Z6E9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBBP6Q7Z6E9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBBP6Q7Z6E9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBBP6Q7Z6E9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBBP6Q7Z6E9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBBP6Q7Z6E9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBBP6Q7Z6E9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBBP6Q7Z6E9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBBP6Q7Z6E9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBBP6Q7Z6E9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBBP6Q7Z6E9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBBP6Q7Z6E9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBBP6Q7Z6E9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBBP6Q7Z6E9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBBP6Q7Z6E9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBBP6Q7Z6E9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBBP6Q7Z6E9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBBP6Q7Z6E9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBBP6Q7Z6E9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBBP6Q7Z6E9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBBP6Q7Z6E9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBBP6Q7Z6E9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBBP6Q7Z6E9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBBP6Q7Z6E9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RBBP6Q7Z6E9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBBP6Q7Z6E9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBBP6Q7Z6E9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBBP6Q7Z6E9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBBP6Q7Z6E9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBBP6Q7Z6E9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBBP6Q7Z6E9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBBP6Q7Z6E9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBBP6Q7Z6E9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RBBP6Q7Z6E9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBBP6Q7Z6E9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBBP6Q7Z6E9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBBP6Q7Z6E9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBBP6Q7Z6E9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBBP6Q7Z6E9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBBP6Q7Z6E9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBBP6Q7Z6E9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBBP6Q7Z6E9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBBP6Q7Z6E9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBBP6Q7Z6E9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBBP6Q7Z6E9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBBP6Q7Z6E9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBBP6Q7Z6E9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBBP6Q7Z6E9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBBP6Q7Z6E9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBBP6Q7Z6E9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBBP6Q7Z6E9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBBP6Q7Z6E9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBBP6Q7Z6E9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBBP6Q7Z6E9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RBBP6Q7Z6E9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBBP6Q7Z6E9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBBP6Q7Z6E9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms