Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z401

DENND4A, C-myc promoter-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND4AQ7Z401 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND4AQ7Z401 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND4AQ7Z401 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND4AQ7Z401 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND4AQ7Z401 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND4AQ7Z401 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND4AQ7Z401 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND4AQ7Z401 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND4AQ7Z401 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND4AQ7Z401 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND4AQ7Z401 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND4AQ7Z401 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND4AQ7Z401 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND4AQ7Z401 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND4AQ7Z401 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND4AQ7Z401 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND4AQ7Z401 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND4AQ7Z401 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND4AQ7Z401 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND4AQ7Z401 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND4AQ7Z401 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND4AQ7Z401 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DENND4AQ7Z401 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DENND4AQ7Z401 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DENND4AQ7Z401 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DENND4AQ7Z401 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DENND4AQ7Z401 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DENND4AQ7Z401 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND4AQ7Z401 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND4AQ7Z401 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms