Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Z2

RD3, Protein RD3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3Q7Z3Z2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RD3Q7Z3Z2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RD3Q7Z3Z2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms