Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms