Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX7Q7RTT5 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms