Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
HECW1Q76N89 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
HECW1Q76N89 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
HECW1Q76N89 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
HECW1Q76N89 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
HECW1Q76N89 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
HECW1Q76N89 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
HECW1Q76N89 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
HECW1Q76N89 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
HECW1Q76N89 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
HECW1Q76N89 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
HECW1Q76N89 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
HECW1Q76N89 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
HECW1Q76N89 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
HECW1Q76N89 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
HECW1Q76N89 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
HECW1Q76N89 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
HECW1Q76N89 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
HECW1Q76N89 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
HECW1Q76N89 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
HECW1Q76N89 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
HECW1Q76N89 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
HECW1Q76N89 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
HECW1Q76N89 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
HECW1Q76N89 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
HECW1Q76N89 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
HECW1Q76N89 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
HECW1Q76N89 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
HECW1Q76N89 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
HECW1Q76N89 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
HECW1Q76N89 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
HECW1Q76N89 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
HECW1Q76N89 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
HECW1Q76N89 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
HECW1Q76N89 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
HECW1Q76N89 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
HECW1Q76N89 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
HECW1Q76N89 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
HECW1Q76N89 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
HECW1Q76N89 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
HECW1Q76N89 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
HECW1Q76N89 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
HECW1Q76N89 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
HECW1Q76N89 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.07
HECW1Q76N89 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.07
HECW1Q76N89 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
HECW1Q76N89 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
HECW1Q76N89 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
HECW1Q76N89 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
HECW1Q76N89 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
HECW1Q76N89 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
HECW1Q76N89 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
HECW1Q76N89 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
HECW1Q76N89 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
HECW1Q76N89 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
HECW1Q76N89 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC34.24■■■■□ 3.07
HECW1Q76N89 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
HECW1Q76N89 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
HECW1Q76N89 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
HECW1Q76N89 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
HECW1Q76N89 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
HECW1Q76N89 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
HECW1Q76N89 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
HECW1Q76N89 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
HECW1Q76N89 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
HECW1Q76N89 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
HECW1Q76N89 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
HECW1Q76N89 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
HECW1Q76N89 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
HECW1Q76N89 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
HECW1Q76N89 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
HECW1Q76N89 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
HECW1Q76N89 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
HECW1Q76N89 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
HECW1Q76N89 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
HECW1Q76N89 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
HECW1Q76N89 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
HECW1Q76N89 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
HECW1Q76N89 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
HECW1Q76N89 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
HECW1Q76N89 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
HECW1Q76N89 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
HECW1Q76N89 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
HECW1Q76N89 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
HECW1Q76N89 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
HECW1Q76N89 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
HECW1Q76N89 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
HECW1Q76N89 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
HECW1Q76N89 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC34.21■■■■□ 3.07
HECW1Q76N89 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
HECW1Q76N89 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
HECW1Q76N89 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
HECW1Q76N89 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
HECW1Q76N89 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
HECW1Q76N89 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
HECW1Q76N89 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.06
HECW1Q76N89 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
HECW1Q76N89 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
HECW1Q76N89 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
HECW1Q76N89 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms