Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ1

USP49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, humanhuman

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Length 688 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP49Q70CQ1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP49Q70CQ1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP49Q70CQ1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP49Q70CQ1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP49Q70CQ1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP49Q70CQ1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP49Q70CQ1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP49Q70CQ1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
USP49Q70CQ1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP49Q70CQ1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP49Q70CQ1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP49Q70CQ1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP49Q70CQ1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP49Q70CQ1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP49Q70CQ1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP49Q70CQ1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP49Q70CQ1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP49Q70CQ1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP49Q70CQ1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP49Q70CQ1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP49Q70CQ1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP49Q70CQ1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP49Q70CQ1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
USP49Q70CQ1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP49Q70CQ1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP49Q70CQ1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP49Q70CQ1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP49Q70CQ1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
USP49Q70CQ1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP49Q70CQ1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP49Q70CQ1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP49Q70CQ1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP49Q70CQ1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP49Q70CQ1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP49Q70CQ1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP49Q70CQ1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP49Q70CQ1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP49Q70CQ1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP49Q70CQ1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP49Q70CQ1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP49Q70CQ1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP49Q70CQ1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
USP49Q70CQ1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
USP49Q70CQ1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
USP49Q70CQ1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP49Q70CQ1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP49Q70CQ1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP49Q70CQ1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP49Q70CQ1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP49Q70CQ1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP49Q70CQ1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP49Q70CQ1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP49Q70CQ1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP49Q70CQ1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP49Q70CQ1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP49Q70CQ1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP49Q70CQ1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
USP49Q70CQ1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP49Q70CQ1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP49Q70CQ1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP49Q70CQ1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP49Q70CQ1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP49Q70CQ1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP49Q70CQ1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP49Q70CQ1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
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