Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVL6

KIAA1549L, UPF0606 protein KIAA1549L, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549LQ6ZVL6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIAA1549LQ6ZVL6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms