Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SRCAPQ6ZRS2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SRCAPQ6ZRS2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SRCAPQ6ZRS2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SRCAPQ6ZRS2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SRCAPQ6ZRS2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SRCAPQ6ZRS2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SRCAPQ6ZRS2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SRCAPQ6ZRS2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SRCAPQ6ZRS2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SRCAPQ6ZRS2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SRCAPQ6ZRS2 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SRCAPQ6ZRS2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SRCAPQ6ZRS2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SRCAPQ6ZRS2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SRCAPQ6ZRS2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SRCAPQ6ZRS2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SRCAPQ6ZRS2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRCAPQ6ZRS2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRCAPQ6ZRS2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SRCAPQ6ZRS2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRCAPQ6ZRS2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRCAPQ6ZRS2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRCAPQ6ZRS2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRCAPQ6ZRS2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRCAPQ6ZRS2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRCAPQ6ZRS2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRCAPQ6ZRS2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRCAPQ6ZRS2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRCAPQ6ZRS2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SRCAPQ6ZRS2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRCAPQ6ZRS2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRCAPQ6ZRS2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRCAPQ6ZRS2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRCAPQ6ZRS2 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRCAPQ6ZRS2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRCAPQ6ZRS2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRCAPQ6ZRS2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRCAPQ6ZRS2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRCAPQ6ZRS2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRCAPQ6ZRS2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRCAPQ6ZRS2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRCAPQ6ZRS2 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRCAPQ6ZRS2 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SRCAPQ6ZRS2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SRCAPQ6ZRS2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SRCAPQ6ZRS2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SRCAPQ6ZRS2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SRCAPQ6ZRS2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SRCAPQ6ZRS2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SRCAPQ6ZRS2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SRCAPQ6ZRS2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SRCAPQ6ZRS2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SRCAPQ6ZRS2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SRCAPQ6ZRS2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SRCAPQ6ZRS2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SRCAPQ6ZRS2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SRCAPQ6ZRS2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SRCAPQ6ZRS2 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SRCAPQ6ZRS2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SRCAPQ6ZRS2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SRCAPQ6ZRS2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SRCAPQ6ZRS2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SRCAPQ6ZRS2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SRCAPQ6ZRS2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SRCAPQ6ZRS2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SRCAPQ6ZRS2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
SRCAPQ6ZRS2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SRCAPQ6ZRS2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SRCAPQ6ZRS2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
SRCAPQ6ZRS2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SRCAPQ6ZRS2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SRCAPQ6ZRS2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SRCAPQ6ZRS2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SRCAPQ6ZRS2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SRCAPQ6ZRS2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SRCAPQ6ZRS2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SRCAPQ6ZRS2 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SRCAPQ6ZRS2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SRCAPQ6ZRS2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SRCAPQ6ZRS2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SRCAPQ6ZRS2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SRCAPQ6ZRS2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SRCAPQ6ZRS2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SRCAPQ6ZRS2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SRCAPQ6ZRS2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SRCAPQ6ZRS2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SRCAPQ6ZRS2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SRCAPQ6ZRS2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SRCAPQ6ZRS2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SRCAPQ6ZRS2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SRCAPQ6ZRS2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SRCAPQ6ZRS2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SRCAPQ6ZRS2 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SRCAPQ6ZRS2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SRCAPQ6ZRS2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SRCAPQ6ZRS2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SRCAPQ6ZRS2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SRCAPQ6ZRS2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SRCAPQ6ZRS2 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms