Protein–RNA interactions for Protein: Q6YHK3

CD109, CD109 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD109Q6YHK3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC33.8■■■■□ 3
CD109Q6YHK3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CD109Q6YHK3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
CD109Q6YHK3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
CD109Q6YHK3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CD109Q6YHK3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC33.8■■■■□ 3
CD109Q6YHK3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CD109Q6YHK3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
CD109Q6YHK3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC33.79■■■■□ 3
CD109Q6YHK3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CD109Q6YHK3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
CD109Q6YHK3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CD109Q6YHK3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CD109Q6YHK3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CD109Q6YHK3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CD109Q6YHK3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
CD109Q6YHK3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
CD109Q6YHK3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
CD109Q6YHK3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CD109Q6YHK3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
CD109Q6YHK3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CD109Q6YHK3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CD109Q6YHK3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CD109Q6YHK3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CD109Q6YHK3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
CD109Q6YHK3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
CD109Q6YHK3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CD109Q6YHK3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
CD109Q6YHK3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CD109Q6YHK3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
CD109Q6YHK3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CD109Q6YHK3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CD109Q6YHK3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CD109Q6YHK3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CD109Q6YHK3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
CD109Q6YHK3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CD109Q6YHK3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CD109Q6YHK3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
CD109Q6YHK3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
CD109Q6YHK3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CD109Q6YHK3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CD109Q6YHK3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CD109Q6YHK3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
CD109Q6YHK3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
CD109Q6YHK3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CD109Q6YHK3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CD109Q6YHK3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
CD109Q6YHK3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
CD109Q6YHK3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CD109Q6YHK3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CD109Q6YHK3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CD109Q6YHK3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CD109Q6YHK3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
CD109Q6YHK3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CD109Q6YHK3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CD109Q6YHK3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
CD109Q6YHK3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CD109Q6YHK3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CD109Q6YHK3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CD109Q6YHK3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CD109Q6YHK3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CD109Q6YHK3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CD109Q6YHK3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CD109Q6YHK3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CD109Q6YHK3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CD109Q6YHK3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CD109Q6YHK3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CD109Q6YHK3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CD109Q6YHK3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CD109Q6YHK3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CD109Q6YHK3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CD109Q6YHK3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CD109Q6YHK3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CD109Q6YHK3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CD109Q6YHK3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CD109Q6YHK3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CD109Q6YHK3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CD109Q6YHK3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CD109Q6YHK3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
CD109Q6YHK3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
CD109Q6YHK3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
CD109Q6YHK3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
CD109Q6YHK3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.98
CD109Q6YHK3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
CD109Q6YHK3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CD109Q6YHK3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CD109Q6YHK3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CD109Q6YHK3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CD109Q6YHK3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CD109Q6YHK3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CD109Q6YHK3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CD109Q6YHK3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CD109Q6YHK3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CD109Q6YHK3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CD109Q6YHK3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CD109Q6YHK3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
CD109Q6YHK3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CD109Q6YHK3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CD109Q6YHK3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
CD109Q6YHK3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms