Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPR3

RPTN, Repetin, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPTNQ6XPR3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPTNQ6XPR3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RPTNQ6XPR3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms