Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC4A10Q6U841 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SLC4A10Q6U841 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SLC4A10Q6U841 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SLC4A10Q6U841 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC4A10Q6U841 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC4A10Q6U841 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC4A10Q6U841 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC4A10Q6U841 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC4A10Q6U841 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC4A10Q6U841 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC4A10Q6U841 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC4A10Q6U841 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC4A10Q6U841 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC4A10Q6U841 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC4A10Q6U841 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC4A10Q6U841 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC4A10Q6U841 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC4A10Q6U841 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC4A10Q6U841 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC4A10Q6U841 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC4A10Q6U841 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC4A10Q6U841 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC4A10Q6U841 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC4A10Q6U841 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC4A10Q6U841 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC4A10Q6U841 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC4A10Q6U841 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC4A10Q6U841 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC4A10Q6U841 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC4A10Q6U841 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC4A10Q6U841 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC4A10Q6U841 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC4A10Q6U841 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC4A10Q6U841 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC4A10Q6U841 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC4A10Q6U841 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC4A10Q6U841 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC4A10Q6U841 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC4A10Q6U841 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC4A10Q6U841 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC4A10Q6U841 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC4A10Q6U841 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC4A10Q6U841 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC4A10Q6U841 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC4A10Q6U841 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC4A10Q6U841 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC4A10Q6U841 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC4A10Q6U841 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC4A10Q6U841 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC4A10Q6U841 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC4A10Q6U841 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC4A10Q6U841 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC4A10Q6U841 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC4A10Q6U841 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC4A10Q6U841 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC4A10Q6U841 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC4A10Q6U841 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC4A10Q6U841 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC4A10Q6U841 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC4A10Q6U841 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC4A10Q6U841 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC4A10Q6U841 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC4A10Q6U841 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC4A10Q6U841 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SLC4A10Q6U841 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SLC4A10Q6U841 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SLC4A10Q6U841 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC4A10Q6U841 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC4A10Q6U841 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC4A10Q6U841 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC4A10Q6U841 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC4A10Q6U841 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC4A10Q6U841 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC4A10Q6U841 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC4A10Q6U841 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC4A10Q6U841 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC4A10Q6U841 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC4A10Q6U841 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC4A10Q6U841 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC4A10Q6U841 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC4A10Q6U841 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC4A10Q6U841 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC4A10Q6U841 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC4A10Q6U841 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC4A10Q6U841 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC4A10Q6U841 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC4A10Q6U841 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC4A10Q6U841 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC4A10Q6U841 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC4A10Q6U841 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC4A10Q6U841 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC4A10Q6U841 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC4A10Q6U841 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC4A10Q6U841 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC4A10Q6U841 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC4A10Q6U841 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC4A10Q6U841 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC4A10Q6U841 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC4A10Q6U841 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms