Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms