Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
EDC4Q6P2E9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
EDC4Q6P2E9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
EDC4Q6P2E9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
EDC4Q6P2E9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
EDC4Q6P2E9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
EDC4Q6P2E9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
EDC4Q6P2E9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
EDC4Q6P2E9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
EDC4Q6P2E9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
EDC4Q6P2E9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
EDC4Q6P2E9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
EDC4Q6P2E9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
EDC4Q6P2E9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
EDC4Q6P2E9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
EDC4Q6P2E9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
EDC4Q6P2E9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
EDC4Q6P2E9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
EDC4Q6P2E9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
EDC4Q6P2E9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
EDC4Q6P2E9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
EDC4Q6P2E9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
EDC4Q6P2E9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
EDC4Q6P2E9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
EDC4Q6P2E9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
EDC4Q6P2E9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
EDC4Q6P2E9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
EDC4Q6P2E9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
EDC4Q6P2E9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
EDC4Q6P2E9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
EDC4Q6P2E9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
EDC4Q6P2E9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
EDC4Q6P2E9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
EDC4Q6P2E9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
EDC4Q6P2E9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
EDC4Q6P2E9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
EDC4Q6P2E9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
EDC4Q6P2E9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
EDC4Q6P2E9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
EDC4Q6P2E9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
EDC4Q6P2E9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
EDC4Q6P2E9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
EDC4Q6P2E9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
EDC4Q6P2E9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
EDC4Q6P2E9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
EDC4Q6P2E9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
EDC4Q6P2E9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
EDC4Q6P2E9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
EDC4Q6P2E9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
EDC4Q6P2E9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
EDC4Q6P2E9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
EDC4Q6P2E9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
EDC4Q6P2E9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
EDC4Q6P2E9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
EDC4Q6P2E9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
EDC4Q6P2E9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
EDC4Q6P2E9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
EDC4Q6P2E9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
EDC4Q6P2E9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
EDC4Q6P2E9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
EDC4Q6P2E9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
EDC4Q6P2E9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
EDC4Q6P2E9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
EDC4Q6P2E9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
EDC4Q6P2E9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
EDC4Q6P2E9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
EDC4Q6P2E9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
EDC4Q6P2E9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
EDC4Q6P2E9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
EDC4Q6P2E9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
EDC4Q6P2E9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
EDC4Q6P2E9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
EDC4Q6P2E9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
EDC4Q6P2E9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
EDC4Q6P2E9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
EDC4Q6P2E9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
EDC4Q6P2E9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
EDC4Q6P2E9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
EDC4Q6P2E9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
EDC4Q6P2E9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
EDC4Q6P2E9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
EDC4Q6P2E9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
EDC4Q6P2E9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
EDC4Q6P2E9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
EDC4Q6P2E9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
EDC4Q6P2E9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
EDC4Q6P2E9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
EDC4Q6P2E9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
EDC4Q6P2E9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
EDC4Q6P2E9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
EDC4Q6P2E9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
EDC4Q6P2E9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
EDC4Q6P2E9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
EDC4Q6P2E9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
EDC4Q6P2E9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
EDC4Q6P2E9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
EDC4Q6P2E9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
EDC4Q6P2E9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
EDC4Q6P2E9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
EDC4Q6P2E9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.1 ms