Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRPF40BQ6NWY9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRPF40BQ6NWY9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRPF40BQ6NWY9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRPF40BQ6NWY9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRPF40BQ6NWY9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRPF40BQ6NWY9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRPF40BQ6NWY9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRPF40BQ6NWY9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRPF40BQ6NWY9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRPF40BQ6NWY9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
PRPF40BQ6NWY9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRPF40BQ6NWY9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRPF40BQ6NWY9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRPF40BQ6NWY9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRPF40BQ6NWY9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRPF40BQ6NWY9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRPF40BQ6NWY9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRPF40BQ6NWY9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRPF40BQ6NWY9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRPF40BQ6NWY9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRPF40BQ6NWY9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRPF40BQ6NWY9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRPF40BQ6NWY9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRPF40BQ6NWY9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRPF40BQ6NWY9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRPF40BQ6NWY9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRPF40BQ6NWY9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRPF40BQ6NWY9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRPF40BQ6NWY9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRPF40BQ6NWY9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRPF40BQ6NWY9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRPF40BQ6NWY9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms