Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC70Q6NSX1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC70Q6NSX1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC70Q6NSX1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC70Q6NSX1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC70Q6NSX1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC70Q6NSX1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC70Q6NSX1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC70Q6NSX1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC70Q6NSX1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC70Q6NSX1 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC70Q6NSX1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC70Q6NSX1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC70Q6NSX1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC70Q6NSX1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC70Q6NSX1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC70Q6NSX1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC70Q6NSX1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC70Q6NSX1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC70Q6NSX1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC70Q6NSX1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC70Q6NSX1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC70Q6NSX1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC70Q6NSX1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC70Q6NSX1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC70Q6NSX1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC70Q6NSX1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC70Q6NSX1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC70Q6NSX1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC70Q6NSX1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC70Q6NSX1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC70Q6NSX1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC70Q6NSX1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC70Q6NSX1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC70Q6NSX1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC70Q6NSX1 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC70Q6NSX1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC70Q6NSX1 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC70Q6NSX1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC70Q6NSX1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC70Q6NSX1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC70Q6NSX1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC70Q6NSX1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC70Q6NSX1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC70Q6NSX1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC70Q6NSX1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC70Q6NSX1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC70Q6NSX1 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC70Q6NSX1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC70Q6NSX1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC70Q6NSX1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC70Q6NSX1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC70Q6NSX1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC70Q6NSX1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC70Q6NSX1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC70Q6NSX1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC70Q6NSX1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC70Q6NSX1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC70Q6NSX1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC70Q6NSX1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC70Q6NSX1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC70Q6NSX1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC70Q6NSX1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC70Q6NSX1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC70Q6NSX1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC70Q6NSX1 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC70Q6NSX1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC70Q6NSX1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC70Q6NSX1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC70Q6NSX1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC70Q6NSX1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC70Q6NSX1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC70Q6NSX1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC70Q6NSX1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC70Q6NSX1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC70Q6NSX1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC70Q6NSX1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC70Q6NSX1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC70Q6NSX1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC70Q6NSX1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC70Q6NSX1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC70Q6NSX1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC70Q6NSX1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC70Q6NSX1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC70Q6NSX1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC70Q6NSX1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC70Q6NSX1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC70Q6NSX1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC70Q6NSX1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC70Q6NSX1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC70Q6NSX1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC70Q6NSX1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC70Q6NSX1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC70Q6NSX1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC70Q6NSX1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC70Q6NSX1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC70Q6NSX1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC70Q6NSX1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC70Q6NSX1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC70Q6NSX1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms