Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms