Protein–RNA interactions for Protein: Q6AZY7

SCARA3, Scavenger receptor class A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARA3Q6AZY7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCARA3Q6AZY7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCARA3Q6AZY7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCARA3Q6AZY7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCARA3Q6AZY7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCARA3Q6AZY7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCARA3Q6AZY7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCARA3Q6AZY7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCARA3Q6AZY7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCARA3Q6AZY7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SCARA3Q6AZY7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCARA3Q6AZY7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCARA3Q6AZY7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCARA3Q6AZY7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCARA3Q6AZY7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCARA3Q6AZY7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCARA3Q6AZY7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCARA3Q6AZY7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCARA3Q6AZY7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCARA3Q6AZY7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCARA3Q6AZY7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCARA3Q6AZY7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SCARA3Q6AZY7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCARA3Q6AZY7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCARA3Q6AZY7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCARA3Q6AZY7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCARA3Q6AZY7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCARA3Q6AZY7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCARA3Q6AZY7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCARA3Q6AZY7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCARA3Q6AZY7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCARA3Q6AZY7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCARA3Q6AZY7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCARA3Q6AZY7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCARA3Q6AZY7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCARA3Q6AZY7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCARA3Q6AZY7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCARA3Q6AZY7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCARA3Q6AZY7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCARA3Q6AZY7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCARA3Q6AZY7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCARA3Q6AZY7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCARA3Q6AZY7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCARA3Q6AZY7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCARA3Q6AZY7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCARA3Q6AZY7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCARA3Q6AZY7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCARA3Q6AZY7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCARA3Q6AZY7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCARA3Q6AZY7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCARA3Q6AZY7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCARA3Q6AZY7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCARA3Q6AZY7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCARA3Q6AZY7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCARA3Q6AZY7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCARA3Q6AZY7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCARA3Q6AZY7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCARA3Q6AZY7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCARA3Q6AZY7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCARA3Q6AZY7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCARA3Q6AZY7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCARA3Q6AZY7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SCARA3Q6AZY7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCARA3Q6AZY7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCARA3Q6AZY7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCARA3Q6AZY7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCARA3Q6AZY7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCARA3Q6AZY7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCARA3Q6AZY7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCARA3Q6AZY7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCARA3Q6AZY7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SCARA3Q6AZY7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCARA3Q6AZY7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCARA3Q6AZY7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SCARA3Q6AZY7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCARA3Q6AZY7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SCARA3Q6AZY7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCARA3Q6AZY7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCARA3Q6AZY7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCARA3Q6AZY7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCARA3Q6AZY7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCARA3Q6AZY7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCARA3Q6AZY7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCARA3Q6AZY7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCARA3Q6AZY7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCARA3Q6AZY7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCARA3Q6AZY7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCARA3Q6AZY7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCARA3Q6AZY7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCARA3Q6AZY7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCARA3Q6AZY7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCARA3Q6AZY7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SCARA3Q6AZY7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCARA3Q6AZY7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCARA3Q6AZY7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCARA3Q6AZY7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCARA3Q6AZY7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCARA3Q6AZY7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCARA3Q6AZY7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCARA3Q6AZY7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms