Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CREB3L3Q68CJ9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms