Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZM2

RRAGB, Ras-related GTP-binding protein B, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRAGBQ5VZM2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RRAGBQ5VZM2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRAGBQ5VZM2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRAGBQ5VZM2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRAGBQ5VZM2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRAGBQ5VZM2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRAGBQ5VZM2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRAGBQ5VZM2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRAGBQ5VZM2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRAGBQ5VZM2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRAGBQ5VZM2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRAGBQ5VZM2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRAGBQ5VZM2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RRAGBQ5VZM2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRAGBQ5VZM2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRAGBQ5VZM2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRAGBQ5VZM2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms