Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
CHIC1Q5VXU3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
CHIC1Q5VXU3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
CHIC1Q5VXU3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
CHIC1Q5VXU3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC37.3■■■■□ 3.56
CHIC1Q5VXU3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
CHIC1Q5VXU3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
CHIC1Q5VXU3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
CHIC1Q5VXU3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
CHIC1Q5VXU3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CHIC1Q5VXU3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CHIC1Q5VXU3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CHIC1Q5VXU3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
CHIC1Q5VXU3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CHIC1Q5VXU3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CHIC1Q5VXU3 COA4-204ENST00000541455 1038 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
CHIC1Q5VXU3 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
CHIC1Q5VXU3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
CHIC1Q5VXU3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CHIC1Q5VXU3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
CHIC1Q5VXU3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
CHIC1Q5VXU3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CHIC1Q5VXU3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
CHIC1Q5VXU3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CHIC1Q5VXU3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
CHIC1Q5VXU3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
CHIC1Q5VXU3 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
CHIC1Q5VXU3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
CHIC1Q5VXU3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CHIC1Q5VXU3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CHIC1Q5VXU3 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CHIC1Q5VXU3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CHIC1Q5VXU3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CHIC1Q5VXU3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
CHIC1Q5VXU3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
CHIC1Q5VXU3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
CHIC1Q5VXU3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
CHIC1Q5VXU3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
CHIC1Q5VXU3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.56
CHIC1Q5VXU3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC37.26■■■■□ 3.55
CHIC1Q5VXU3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CHIC1Q5VXU3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CHIC1Q5VXU3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CHIC1Q5VXU3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
CHIC1Q5VXU3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
CHIC1Q5VXU3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CHIC1Q5VXU3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CHIC1Q5VXU3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CHIC1Q5VXU3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
CHIC1Q5VXU3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
CHIC1Q5VXU3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
CHIC1Q5VXU3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
CHIC1Q5VXU3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CHIC1Q5VXU3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CHIC1Q5VXU3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
CHIC1Q5VXU3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
CHIC1Q5VXU3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
CHIC1Q5VXU3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
CHIC1Q5VXU3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
CHIC1Q5VXU3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
CHIC1Q5VXU3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
CHIC1Q5VXU3 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.23■■■■□ 3.55
CHIC1Q5VXU3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
CHIC1Q5VXU3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
CHIC1Q5VXU3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
CHIC1Q5VXU3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
CHIC1Q5VXU3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
CHIC1Q5VXU3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CHIC1Q5VXU3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CHIC1Q5VXU3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CHIC1Q5VXU3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CHIC1Q5VXU3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CHIC1Q5VXU3 METTL23-207ENST00000588783 1184 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CHIC1Q5VXU3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CHIC1Q5VXU3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CHIC1Q5VXU3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CHIC1Q5VXU3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CHIC1Q5VXU3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CHIC1Q5VXU3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CHIC1Q5VXU3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CHIC1Q5VXU3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CHIC1Q5VXU3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
CHIC1Q5VXU3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CHIC1Q5VXU3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CHIC1Q5VXU3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
CHIC1Q5VXU3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CHIC1Q5VXU3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
CHIC1Q5VXU3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CHIC1Q5VXU3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CHIC1Q5VXU3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
CHIC1Q5VXU3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
CHIC1Q5VXU3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CHIC1Q5VXU3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CHIC1Q5VXU3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
CHIC1Q5VXU3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CHIC1Q5VXU3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CHIC1Q5VXU3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CHIC1Q5VXU3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CHIC1Q5VXU3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CHIC1Q5VXU3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms