Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWW1

C1QL3, Complement C1q-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QL3Q5VWW1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
C1QL3Q5VWW1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
C1QL3Q5VWW1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1QL3Q5VWW1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1QL3Q5VWW1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1QL3Q5VWW1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1QL3Q5VWW1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1QL3Q5VWW1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
C1QL3Q5VWW1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1QL3Q5VWW1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1QL3Q5VWW1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1QL3Q5VWW1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
C1QL3Q5VWW1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1QL3Q5VWW1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1QL3Q5VWW1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1QL3Q5VWW1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1QL3Q5VWW1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1QL3Q5VWW1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1QL3Q5VWW1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1QL3Q5VWW1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1QL3Q5VWW1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1QL3Q5VWW1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1QL3Q5VWW1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1QL3Q5VWW1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1QL3Q5VWW1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
C1QL3Q5VWW1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1QL3Q5VWW1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
C1QL3Q5VWW1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1QL3Q5VWW1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1QL3Q5VWW1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1QL3Q5VWW1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1QL3Q5VWW1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1QL3Q5VWW1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1QL3Q5VWW1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1QL3Q5VWW1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1QL3Q5VWW1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1QL3Q5VWW1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1QL3Q5VWW1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1QL3Q5VWW1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1QL3Q5VWW1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1QL3Q5VWW1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1QL3Q5VWW1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1QL3Q5VWW1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1QL3Q5VWW1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1QL3Q5VWW1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1QL3Q5VWW1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1QL3Q5VWW1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1QL3Q5VWW1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1QL3Q5VWW1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
C1QL3Q5VWW1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1QL3Q5VWW1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1QL3Q5VWW1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1QL3Q5VWW1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1QL3Q5VWW1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1QL3Q5VWW1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1QL3Q5VWW1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1QL3Q5VWW1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1QL3Q5VWW1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
C1QL3Q5VWW1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1QL3Q5VWW1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1QL3Q5VWW1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
C1QL3Q5VWW1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1QL3Q5VWW1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C1QL3Q5VWW1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C1QL3Q5VWW1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C1QL3Q5VWW1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C1QL3Q5VWW1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C1QL3Q5VWW1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C1QL3Q5VWW1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C1QL3Q5VWW1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1QL3Q5VWW1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1QL3Q5VWW1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1QL3Q5VWW1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1QL3Q5VWW1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1QL3Q5VWW1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1QL3Q5VWW1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1QL3Q5VWW1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1QL3Q5VWW1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1QL3Q5VWW1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1QL3Q5VWW1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1QL3Q5VWW1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
C1QL3Q5VWW1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1QL3Q5VWW1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1QL3Q5VWW1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1QL3Q5VWW1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1QL3Q5VWW1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1QL3Q5VWW1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1QL3Q5VWW1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1QL3Q5VWW1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1QL3Q5VWW1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1QL3Q5VWW1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1QL3Q5VWW1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1QL3Q5VWW1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1QL3Q5VWW1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1QL3Q5VWW1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1QL3Q5VWW1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1QL3Q5VWW1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1QL3Q5VWW1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1QL3Q5VWW1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1QL3Q5VWW1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms