Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWI1

TCERG1L, Transcription elongation regulator 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCERG1LQ5VWI1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCERG1LQ5VWI1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCERG1LQ5VWI1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCERG1LQ5VWI1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCERG1LQ5VWI1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCERG1LQ5VWI1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCERG1LQ5VWI1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCERG1LQ5VWI1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCERG1LQ5VWI1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TCERG1LQ5VWI1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TCERG1LQ5VWI1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCERG1LQ5VWI1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCERG1LQ5VWI1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCERG1LQ5VWI1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCERG1LQ5VWI1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCERG1LQ5VWI1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCERG1LQ5VWI1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TCERG1LQ5VWI1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCERG1LQ5VWI1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCERG1LQ5VWI1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCERG1LQ5VWI1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCERG1LQ5VWI1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCERG1LQ5VWI1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCERG1LQ5VWI1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCERG1LQ5VWI1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCERG1LQ5VWI1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCERG1LQ5VWI1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCERG1LQ5VWI1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCERG1LQ5VWI1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCERG1LQ5VWI1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCERG1LQ5VWI1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCERG1LQ5VWI1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCERG1LQ5VWI1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCERG1LQ5VWI1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCERG1LQ5VWI1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCERG1LQ5VWI1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCERG1LQ5VWI1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCERG1LQ5VWI1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCERG1LQ5VWI1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCERG1LQ5VWI1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCERG1LQ5VWI1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCERG1LQ5VWI1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TCERG1LQ5VWI1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TCERG1LQ5VWI1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TCERG1LQ5VWI1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TCERG1LQ5VWI1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TCERG1LQ5VWI1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TCERG1LQ5VWI1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TCERG1LQ5VWI1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TCERG1LQ5VWI1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TCERG1LQ5VWI1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TCERG1LQ5VWI1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TCERG1LQ5VWI1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TCERG1LQ5VWI1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TCERG1LQ5VWI1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TCERG1LQ5VWI1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TCERG1LQ5VWI1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TCERG1LQ5VWI1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TCERG1LQ5VWI1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TCERG1LQ5VWI1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCERG1LQ5VWI1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCERG1LQ5VWI1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCERG1LQ5VWI1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCERG1LQ5VWI1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCERG1LQ5VWI1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCERG1LQ5VWI1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCERG1LQ5VWI1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCERG1LQ5VWI1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCERG1LQ5VWI1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCERG1LQ5VWI1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TCERG1LQ5VWI1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCERG1LQ5VWI1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCERG1LQ5VWI1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCERG1LQ5VWI1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCERG1LQ5VWI1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCERG1LQ5VWI1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCERG1LQ5VWI1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCERG1LQ5VWI1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCERG1LQ5VWI1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCERG1LQ5VWI1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCERG1LQ5VWI1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCERG1LQ5VWI1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCERG1LQ5VWI1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCERG1LQ5VWI1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCERG1LQ5VWI1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCERG1LQ5VWI1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCERG1LQ5VWI1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCERG1LQ5VWI1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCERG1LQ5VWI1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCERG1LQ5VWI1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCERG1LQ5VWI1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCERG1LQ5VWI1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCERG1LQ5VWI1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCERG1LQ5VWI1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCERG1LQ5VWI1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCERG1LQ5VWI1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCERG1LQ5VWI1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TCERG1LQ5VWI1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCERG1LQ5VWI1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCERG1LQ5VWI1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms