Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV17

OTUD1, OTU domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD1Q5VV17 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUD1Q5VV17 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187.5 ms