Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUE5

C1orf53, Uncharacterized protein C1orf53, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf53Q5VUE5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
C1orf53Q5VUE5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
C1orf53Q5VUE5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C1orf53Q5VUE5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C1orf53Q5VUE5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C1orf53Q5VUE5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1orf53Q5VUE5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1orf53Q5VUE5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1orf53Q5VUE5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1orf53Q5VUE5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1orf53Q5VUE5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1orf53Q5VUE5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1orf53Q5VUE5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1orf53Q5VUE5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1orf53Q5VUE5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1orf53Q5VUE5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
C1orf53Q5VUE5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1orf53Q5VUE5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1orf53Q5VUE5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1orf53Q5VUE5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1orf53Q5VUE5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1orf53Q5VUE5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1orf53Q5VUE5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1orf53Q5VUE5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1orf53Q5VUE5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
C1orf53Q5VUE5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1orf53Q5VUE5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms